تتطلع إدارة المنشآت الإصلاحية والعقابية بتنفيذ الأحكام القضائية الصادرة من محاكم الدولة بحق المتورطين في ارتكاب الجرائم والأفعال المناهضة للقانون بالحبس إلى مدة طويلة أو محدودة أو الإبعاد خارج الدولة إلى جانب الأحكام المتعلقة بالقصاص البدني وفق منطوق الحكم الصادر بحق كل حالة على حده.

تتولى الإشراف على إدارة السجن المركزي ونزلائه من الرجال والنساء بالتنسيق مع أقسام التوقيف بإدارة البحث الجنائي.
تعمل الادارة في ضوء مفهوم وموجهات فلسفة العقاب الرامية إلى إصلاح وتهذيب وإعادة تأهيل السجناء ورعاية حقوقهم الإنسانية والمادية والمعنوية المنصوص عليها بدستور دولة الإمارات العربية المتحدة.

تتألف إدارة المنشآت الإصلاحية والعقابية من ثلاثة أقسام هي
قسم التنفيذ
قسم التأهيل
قسم المنشآت العقابية